سعید جلیلی در سال 1344 در بخش ماژان از توابع خوسف شهر بیرجند به دنیا آمد. البته در مورد تاریخ و محل تولد وی روایت دیگری نیز موجود است که عنوان میکند وی در سال 1345 در شهر مشهد متولد شده است. جلیلی دوران کودکی و جوانی خود را در محله فقیرنشین طلاب مشهد سپری کرد. سعید جلیلی در سال 1371 ازدواج کرد. همسر وی فاطمه سجادی، پزشک عمومی است. آنها دارای یک فرزند به نام سجاد میباشند گرچه برخی از رسانه ها نام او را حمید عنوان کرده اند.